Avec son  frère  Clotaire 1er et le fils de son demi frère Thierry 1er, Théodebert 1er il soumet les Burgondes, victoire d'Autun contre Gondemar, second fils de Gondebaud assassin des parents de leur mère, en 534, et s'empare d'une partie de leur royaume.

Suite à la défaite de Vouillé (503), les Wisigoths se replient vers l'Espagne et la Septimanie. En 526 Amalaric, leur roi ,  demanda Clotilde fille de Clovis et de Clotilde  et sœur de Childebert en mariage afin d'améliorer les relations avec les Francs. Ce mariage fut accepté et richement dotée ( une partie de l'aquitaine perdue par les Wisigoths en 503 ). Cependant Amalaric était arien et Clotilde catholique très pieuse. Elle dut subir de multiples vexations et humiliations de la part de son mari. Elle parvint à informer son frère des mauvais traitements qu'elle subissait. Childebert monta une expédition contre Amalaric qui fut défait en 531 à Narbonne où il se comporta avec lâcheté fuyant vers Barcelone, il fut tué probablement par l'un des siens. Childebert put faire main basse sur son trésor  et ramena Clotilde qui, hélas, mourut sur le chemin du retour.
Elle fut ensevelie auprès de son père Clovis.

Outre Paris, il détient alors Lyon, Arles et Orléans qui joueront pendant son règne le rôle de métropoles religieuses du royaume Mérovingien. Il s'y tiendra  de 533 à 558 quatre conciles dont trois furent fréquentés par des évêques venus de tout le royaume.

Vers 540 Childebert ordonne l'abandon des derniers sanctuaires païens de son royaume.

Childebert fonde, à Lyon, en 542, le premier hospice ou maison de charité connu en France . La consigne en avait été donnée en 325 au concile de Nicée ( ville de Turquie actuellement Iznik).

En 542 avec Clotaire, il fait une incursion en Espagne, ravage Pampelune , fait le siège de Saragosse. Il doit abandonner Saragosse, ses troupes disséminées par la maladie. Il revient avec l'étole de Saint Vincent. Pour abriter cette relique, il fonde aux portes de Paris l'église Saint Vincent qui deviendra par la suite Saint Germain des prés.

A partir de 543 la peste noire ou peste de Justinien  venue d'orient ravage l'Italie, l'Espagne et une partie de la Gaule pendant plus de 50 ans, Il va s'en suivre une régression terrible pendant plus d'un siècle

Il meurt en 558 sans descendant mâle, son royaume sera rattaché à celui de son frère Clotaire